Στα Γ.Α.Κ. – Τοπικό Αρχείο Νάξου φυλάσσονται αρχεία και συλλογές που αφορούν στην ιστορία της Νάξου και καλύπτουν χρονικά την περίοδο από το 1527 μέχρι σήμερα.
Σύμφωνα με το σύστημα που ακολουθείται στα Γενικά Αρχεία του Κράτους, κάθε αρχείο μετά την εγγραφή του στο βιβλίο εισαγωγής εντάσσεται στην ομάδα αρχείων στην οποία ανήκει (Ειδικό Ευρετήριο). Η ομαδοποίηση γίνεται με δελτία και είναι θεωρητική και όχι φυσική.
Συγκεκριμένα στα Γ.Α.Κ. – Τοπικό Αρχείο Νάξου υπάρχουν οι εξής ομάδες αρχείων: |